Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc39Q9D5Y1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Ccdc39Q9D5Y1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ccdc39Q9D5Y1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ccdc39Q9D5Y1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ccdc39Q9D5Y1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Ccdc39Q9D5Y1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Ccdc39Q9D5Y1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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