Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms