Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms