Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms