Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms