Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms