Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms