Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms