Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms