Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D2Q3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms