Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D1K7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1K7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1K7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1K7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1K7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1K7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1K7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1K7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1K7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1K7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1K7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1K7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1K7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1K7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1K7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1K7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1K7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1K7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1K7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1K7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1K7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1K7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1K7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms