Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms