Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms