Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx17Q9D0I4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms