Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms