Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mms19Q9D071 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mms19Q9D071 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms