Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms