Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snf8Q9CZ28 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms