Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7aQ9CZ04 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cops7aQ9CZ04 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cops7aQ9CZ04 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cops7aQ9CZ04 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cops7aQ9CZ04 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms