Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms