Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms