Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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