Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed5Q9CXE7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms