Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pin4Q9CWW6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms