Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly6kQ9CWP4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6kQ9CWP4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms