Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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