Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms