Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms