Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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