Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms