Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prps2Q9CS42 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms