Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms