Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms