Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ykt6Q9CQW1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ykt6Q9CQW1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ykt6Q9CQW1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ykt6Q9CQW1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ykt6Q9CQW1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ykt6Q9CQW1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ykt6Q9CQW1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ykt6Q9CQW1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ykt6Q9CQW1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms