Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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