Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms