Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms