Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpa3Q9CQ71 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms