Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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