Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms