Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms