Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf8Q99PV0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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