Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.6 ms