Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms