Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms