Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcg3Q99P81 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms