Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem2Q99NH8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem2Q99NH8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms