Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ubqln4Q99NB8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ubqln4Q99NB8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ubqln4Q99NB8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ubqln4Q99NB8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ubqln4Q99NB8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ubqln4Q99NB8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ubqln4Q99NB8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ubqln4Q99NB8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln4Q99NB8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ubqln4Q99NB8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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