Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf6Q99NA9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms