Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KarsQ99MN1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KarsQ99MN1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms